Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNB1P01574 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms