Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POP4O95707 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
POP4O95707 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POP4O95707 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POP4O95707 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POP4O95707 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POP4O95707 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POP4O95707 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POP4O95707 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms