Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms