Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY75O60449 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY75O60449 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY75O60449 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY75O60449 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY75O60449 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms