Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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