Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HACD1B0YJ81 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms