Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms