Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms