Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms