Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SNX13Q9Y5W8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX13Q9Y5W8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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