Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH4Q9UQ05 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms