Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRTO4Q9UKD2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms