Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms