Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP3Q9UFD9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP3Q9UFD9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP3Q9UFD9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms