Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HCN3Q9P1Z3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms