Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms