Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VNN3Q9NY84 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms