Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA2D2Q9NY47 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA2D2Q9NY47 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms