Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms