Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CENPMQ9NSP4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms