Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASS4Q9NQ75 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASS4Q9NQ75 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms