Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms