Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00597Q9H2U6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms