Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM4Q9C037 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms