Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms