Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms