Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms