Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC39A3Q9BRY0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms