Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VRK1Q99986 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms