Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATF6BQ99941 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATF6BQ99941 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms