Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71F1Q96KD3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms