Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP47Q96K76 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP47Q96K76 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms