Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MALSU1Q96EH3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms