Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms