Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ZNF248Q8NDW4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ZNF248Q8NDW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ZNF248Q8NDW4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ZNF248Q8NDW4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF248Q8NDW4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF248Q8NDW4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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