Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGSF1Q8N6C5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms