Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC00518Q8N0U6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LINC00518Q8N0U6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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