Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RP1L1Q8IWN7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RP1L1Q8IWN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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