Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms