Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms