Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NHLRC1Q6VVB1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms