Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C3orf33Q6P1S2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms