Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATL3Q6DD88 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms