Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF123Q5XPI4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF123Q5XPI4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms