Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q499Y3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q499Y3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms