Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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CCDC142Q17RM4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CCDC142Q17RM4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CCDC142Q17RM4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CCDC142Q17RM4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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