Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDO1Q16878 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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