Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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