Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCSK7Q16549 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PCSK7Q16549 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms