Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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